日本國會1990年通過遷都的決議，1992年正式通過《關于遷移國會等的法律》。但此時，日本泡沫經濟已經形成，經濟增速減緩，內閣不得不于1997年決定凍結開工計劃3年。
1999年，日本國土廳官員表示，地址選定之后，一個占地2000公頃、容納10萬居民的“國會城”將首先動工，此外還要興建一些能容納3萬至10萬人的“衛星城”。3個可能入選的城市開始了緊鑼密鼓的宣傳。整個遷都計劃將耗資1050億美元，但分析家估計，最終造價可能高達3500億美元。
二戰結束時，東京人口為278萬，城市型土地利用大致在半徑10公里左右的范圍內。隨著戰后經濟復興，以東京為中心的城市型土地利用急劇擴張。1997年東京都核心區達到625平方公里，后來東京向東擴展到千葉和東南橫濱一帶后，顯得大東京舒展多了。現在據統計，大東京都市圈17200平方公里內已經集聚了大約3258萬人，占全日本人口的25.9%。東京城市的單核心結構導致中心區的地價急劇上升，而當局遲遲不下決心實施功能分解。東京1959年的城市發展戰略，確定了綠帶加衛星城的“一極集中”模式，失控后又調整為“多心多核”模式，無效后1987年又提出構筑“多中心分散型”國土結構的構想，但遭到單核心模式受益者東京都地方政府的抵制。
2001年東京都政府用自己的方法對遷都費用做了一次預算，總額是國會等遷都都審議會提出的推測費用的1.6倍，高達20兆億日元。東京都政府指出，把首都機能分散開去，并不會達到預期的效果。東京都知事甚至稱，把政府遷出作為國家政權中心400多年的東京，是對“歷史的褻瀆”。但是，更有專家認為：當日本國會搬至東京城外60至100公里處建立新的國家行政中心時，那么，東京都市圈就會在擁有神奈川、千葉、崎玉三縣之外，再加上山梨、群馬、厲木和茨城四縣，最終形成一都七縣，懷擁大海的4176萬人口的國際最大都市圈。也有許多贊成的人認為：東京太擁堵了，各項辦公成本太高，如果搬到東京外圍60公里處的地價將比市中心低近100倍，這對新區開發商來講是個十分利好的消息。
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