汪直也許是意識到了在東南沿海的安全系數并不高，因此開始在日本的薩摩的淞浦津（今平戶）以及附近五島列島一帶建立了基地。
這里要提一句的是，汪直在日本薩摩洲的地位是相當高的，日本的《大曲記》就這樣說道：“道可君（松浦隆信）系福祿、武運具昌之人，故有五峰者自大唐至平戶津，于今之印山舊址建唐式宅而居。用其所長，而大唐商船不絕于途，甚至南蠻黑船亦初泊平戶津。唐與南蠻之珍貨年年充盈，京、界諸國商人亦云集于次，有西都之稱。” 把汪直的到來，看成是當地城主賢德的象征，這個恭維不可謂不高。
從另一個意義來說，汪直甚至可以算是結束日本戰國混戰局面的一個關鍵性因素，如果沒有他，恐怕日本至少還要再多亂上一段軍閥混戰的時間。根據日本《南浦文集•鐵炮記》的記載，在嘉靖二十二年（公元1543年），汪直從暹羅帶著三名葡萄牙商人抵達了日本九州南方的種子島，正是通過汪直的推薦、介紹和翻譯，種子島島主時堯才從這三名葡萄牙人那里購買并引進了西洋火槍和彈藥的制造技術，這就是在日本赫赫有名的“鐵炮”。隨后這種火槍和彈藥的制造技術很快在日本流傳，最后為日本戰國天才霸主織田信長認識到了其劃時代的意義，他后來消滅號稱戰國第一的武田騎兵軍團時使用的武器，就是這種鐵炮，并從此開始了日本大兵團作戰使用火槍的時代，也成就了他的一代霸業。
而這個時候的明朝政府，卻對葡萄牙人帶來的武器還保持著懷疑態度，并且因為海禁政策而拒絕和對方進行正常交易，最后獲取這些武器的渠道是居然是“繳獲”，并因此也沒有得到其制造技術，所以后來一直到明末，仿制品“紅衣大炮”炸膛現象還比比皆是，以至士兵們視發炮如死路，發展到要長官騎在炮上才敢開炮。有明一代的火器質量最好的，就是從“佛郎機”人那里“繳獲”來的，所以數量極少。
實際上，不但只是汪直在日本建立了貿易基地，長期以來相當多海商和汪直的部屬，都在日本落了腳，汪直甚至還占據了淞浦津，在那里開國任命官吏， “僭號宋，自稱曰‘徽王’，布置官署咸有名號。控制要害，而三十六島之夷地皆其指使”。這里要注意的是，并不是汪直投靠了日本人，而是日本人投靠了他，或者說他實際占
領并控制了這些地區和居民：“控制要害，而三十六島之夷地皆其指使”，按照現在某些人的標準，也許我們可以這樣說，汪直部下的那些日本人，在日本大約是可以算得日奸的，因為他們投靠了一名外國人，并且在為這個外國人賣命。只是汪直在日本人眼里是個值得尊敬的人，他不但是個誠實的商人，而且信譽好有文化極具風度，還為他們帶來了空前的繁榮和最新的科技，因此即使僅僅是汪直的到來，都可以算是證明他們的城主福分的一種表現，又怎么可能要求他們這樣去看待被汪直所雇傭的同胞呢。
但隨后在七月，汪直的互市基地被抗倭名將俞大猷率部突擊，他在突圍后直接去了日本，此年并無深入內地。之所以一直說是汪直入寇，乃是因為五月入侵的萬余漳、泉海盜和倭寇在多處登陸，尤其是當時的黃巖被破，使得部分明官吏疑心前往那里協助明軍消滅倭寇的汪直并不想真正消滅倭寇，而是在勾結倭寇為盜，所以便把此年的倭寇入侵也歸咎于他。
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